o principal diferença entre B DNA e Z DNA é que o B-DNA é destro, enquanto o Z-DNA é canhoto. Além disso, no B-DNA, as bases que ocupam o núcleo e a estrutura do açúcar-fosfato ocorrem na periferia da hélice, enquanto, no Z-DNA, a estrutura do açúcar-fosfato forma um padrão de zigue-zague; portanto, as bases ocorrem tanto no centro quanto na periferia.

B-DNA e Z-DNA são duas das três conformações de DNA que ocorrem na natureza. Além disso, o diâmetro do B-DNA é de 20 Å e contém 10 resíduos por volta, enquanto o diâmetro do Z-DNA é de 18 Å, e contém 12 resíduos por volta.

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O que é B DNA

O B-DNA é a conformação mais comum e predominante do DNA dentro da célula. Isso significa que o DNA prefere existir na forma B sob condições fisiológicas naturais, incluindo pH e concentrações de sal. Além disso, a forma B do DNA foi descrita pela primeira vez por James Watson e Francis Crick. No entanto, o B-DNA assume outras conformações sob condições variáveis.

Figura 1: As estruturas de A-, B- e Z-DNA

Além disso, as principais características do B-DNA incluem o enrolamento destro, passo de 34 Å com 10 unidades de repetição por volta, unidades de repetição de mononucleotídeo, o diâmetro helicoidal de 20 Å, etc.

O que é Z DNA

Z-DNA é outra conformação de DNA com uma estrutura helicoidal canhota e um esqueleto de açúcar-fosfato formador de padrões em zigue-zague. Além disso, foi descrito pela primeira vez por Andrew Wang e Alexander Rich. O Z-DNA se forma em resposta a altas concentrações de sal. O Z-DNA tem um papel na regulação da expressão gênica, pois pode manter o DNA inativo.

Figura 2: O eixo helicoidal de A-, B- e Z-DNA

Semelhanças entre B DNA e Z DNA

Diferença entre B DNA e Z DNA

Definição

B-DNA refere-se à forma típica de DNA de dupla hélice em que as cadeias se torcem para cima e para a direita em torno da frente do eixo da hélice. Mas, Z-DNA se refere à forma incomum canhota de DNA de dupla hélice, na qual as cadeias se torcem para cima e para a esquerda em torno da frente do eixo da hélice. Além disso, possui 12 pares de bases em cada volta helicoidal e uma ranhura na superfície externa.

Formação

Helix Sense

Enquanto B-DNA é destro, Z-DNA é canhoto. Assim, esta é a principal diferença entre B-DNA e Z-DNA.

Sulcos principais e secundários

Além disso, o B-DNA contém um sulco maior largo e profundo e um sulco menor estreito e profundo, enquanto o Z-DNA contém um sulco principal estreito e profundo e um sulco menor largo e raso.

Bases e a espinha dorsal

Em B-DNA, as bases ocupam o núcleo e a estrutura de açúcar-fosfato ocorre na periferia da hélice, enquanto em Z-DNA, a estrutura de açúcar-fosfato forma um padrão de zigue-zague e, portanto, as bases ocorrem no núcleo, bem como a periferia.

A orientação dos resíduos de açúcar

Além disso, outra diferença entre B-DNA e Z-DNA é a orientação dos resíduos de açúcar. Os resíduos de açúcar no B-DNA têm uma orientação de alteração, enquanto os resíduos de açúcar no Z-DNA não estão se alterando.

Unidade de Repetição

A unidade de repetição do B-DNA é um mononucleotídeo, enquanto a unidade de repetição do Z-DNA é um dinucleotídeo.

Resíduos por volta

O B-DNA contém 10 resíduos por turno, enquanto o Z-DNA contém 12 resíduos por turno.

O ângulo de torção por unidade de repetição

Além disso, o ângulo de torção por unidade de repetição em B-DNA é de 36 °, enquanto o ângulo de torção por unidade de repetição em Z-DNA é de 60 °.

Aumento por Resíduo

O aumento por resíduo no B-DNA é de 3,4 Å enquanto o aumento por resíduo no Z-DNA é 3,75 Å.

Helix Pitch

O passo da hélice também é uma diferença entre B-DNA e Z-DNA. O pitch da hélice do B-DNA é 34 Å enquanto o pitch da hélice do Z-DNA é 45 Å.

A inclinação do par de base

A inclinação do par de bases no B-DNA é de 6 °, enquanto a inclinação de um par de bases no Z-DNA é de 7 °.

Rotação da Unidade Repetitiva

Além disso, a rotação da unidade de repetição do B-DNA é de 36 °, enquanto a rotação da unidade de repetição do Z-DNA é de 60 °.

Diâmetro

O diâmetro do B-DNA é de 20 Å enquanto o diâmetro do Z-DNA é de 18 Å.

Ângulo de torção glicosídico

O ângulo de torção glicosídico é anti para desoxiguanosina e desoxicitidina no B-DNA, enquanto o ângulo de torção glicosídico é sin para desoxiguanosina e anti para desoxicitidina no Z-DNA.

Sugar Pucker

Além disso, o pucker de açúcar é C2 'endo para desoxiguanosina e C3' endo para desoxicitidina em B-DNA, enquanto o pucker de açúcar é C3 'endo para desoxiguanosina e C2' endo para desoxicitidina em Z-DNA.

A distância de P do eixo

A distância de P do eixo é 9,0 Å para dGpC e dCpG em B-DNA, enquanto a distância de P do eixo é 8,0 Å para dGpC e 6,9 ​​Å para dCpG em Z-DNA.

Conclusão

B-DNA é a forma comum de DNA que ocorre nas células. É destro e consiste em bases no núcleo e no esqueleto açúcar-fosfato na estrutura periférica. Além disso, contém 10 nucleotídeos por turno. A largura da hélice do DNA é 20 Å. Por outro lado, o Z-DNA é uma forma canhota e menos comum de DNA, ocorrendo em altas concentrações de sal. Além disso, sua estrutura de açúcar-fosfato mostra um padrão de zigue-zague. Ele também contém 6 dinucleotídeos por turno. Além disso, a largura do Z-DNA é 18 Å. Portanto, a principal diferença entre B-DNA e Z-DNA é a estrutura helicoidal, geometria e dimensões.

Referências:

1. “Z-DNA, uma forma de DNA canhoto”. Biociclopédia, disponível aqui.

Cortesia de imagem:

1. “Dnaconformations” Por Mauroesguerroto - Trabalho próprio (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 2. “B & Z & A DNA formula” Por Lankenau na Wikipedia em inglês - Transferido de en.wikipedia para Commons. (Domínio Público) via Commons Wikimedia