Como ler um mapa de plasmídeo
Índice:
Um mapa de plasmídeo são as posições relativas dos elementos dentro do plasmídeo. Um mapa de plasmídeo pode ser lido compreendendo as características do plasmídeo. Eles são o nome e o tamanho do plasmídeo, os elementos do plasmídeo, suas posições relativas e a orientação do promotor. A origem de replicação (ORI), gene de resistência a antibióticos, sítio de clonagem múltipla (MCS), inserção ou gene de interesse, região promotora, marcador selecionável e sítio de ligação do primer são os elementos de um plasmídeo. As posições relativas dos elementos em um plasmídeo podem ser determinadas mapeando o plasmídeo. O processo envolvido no mapeamento de plasmídeos é denominado mapeamento de restrição.
Principais áreas cobertas
1. O que é um mapa de plasmídeo - Definição, Mapeamento de Restrição 2. Como ler um mapa de plasmídeo - Características de um Plasmid MapP
Termos-chave: Elementos, Nome e Tamanho do Plasmídeo, Orientação do Promotor, Mapa do Plasmídeo, Enzimas de Restrição, Mapeamento de Restrição
O que é um mapa de plasmídeo
Um mapa de plasmídeo é uma representação gráfica de um plasmídeo, que mostra as localizações dos principais pontos de referência ou elementos do plasmídeo. As posições relativas dos elementos dentro de um plasmídeo podem ser identificadas por mapeamento de restrição. Um mapa de restrição é um mapa de locais de reconhecimento de restrição dentro de um plasmídeo particular. Portanto, está envolvido na digestão do plasmídeo por enzimas de restrição. Um mapa de restrição é mostrado na figura 1.
Figura 1: Mapa de restrição
Dois métodos podem ser usados no mapeamento de restrição:
1. Digestão de restrição
- Digestão de restrição do plasmídeo com uma ou duas enzimas de restrição
- Mapeamento do plasmídeo com base nos tamanhos dos fragmentos resultantes do plasmídeo
2. Sequenciamento
- Sequenciamento de todo o plasmídeo
- Identificação dos elementos do plasmídeo
Como ler um mapa de plasmídeo
Figura 2: Mapa de plasmídeo
A leitura de um mapa de plasmídeo se concentra principalmente nas características do plasmídeo. Eles são;
1. O nome e o tamanho do plasmídeo
2. Os elementos de um plasmídeo –
3. As posições relativas dos elementos dentro do plasmídeo
4. A orientação do promotor
Conclusão
Um mapa de plasmídeo pode ser lido compreendendo as características do mapa de plasmídeo, como o nome e o tamanho do plasmídeo, o tipo de elementos no plasmídeo e suas posições relativas e a orientação do promotor.
Referência:
1. “O que é um plasmídeo?” Addgene, disponível aqui.
Cortesia de imagem:
1. “Mapa PDONR221” de Nothingserious - Analisar Sequência: pDONR221. Addgene. Obtido em 24 de janeiro de 2016 (CC0) via Commons Wikimedia 2. “Vetor de clonagem PGEX-3X 'Por Magnus Manske - Criado por Magnus Manske (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
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