Como funciona o sequenciamento Illumina

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Anonim

O sequenciamento Illumina é um método de sequenciamento de última geração, também chamado de “sequenciamento por síntese”Método. O sequenciamento Illumina está envolvido no processamento de milhões de fragmentos em paralelo. As quatro etapas básicas envolvidas no fluxo de trabalho de sequenciamento Illumina são preparação da biblioteca, geração de cluster, sequenciamento e análise de dados, que são descritos posteriormente neste artigo.

Principais áreas cobertas

1. O que é sequenciamento Illumina - Definição, fatos, vantagens 2. Como funciona o sequenciamento Illumina - Processo de Sequenciamento Illumina: - Preparação de Biblioteca - Geração de Cluster - Sequenciamento - Análise de Dados

Termos-chave: Geração de Cluster, Análise de Dados, Sequenciamento Illumina, Preparação de Biblioteca, Sequenciamento por Síntese

O que é o sequenciamento Illumina

A tecnologia de sequenciamento ou sequenciamento por síntese (SBS) da Illumina é a tecnologia de sequenciamento de última geração mais amplamente usada no mundo. Mais de 90% dos dados de sequenciamento do mundo são gerados pelo sequenciamento da Illumina. Foi originalmente desenvolvido por Shankar Balasubramanian e David Klenerman da Universidade de Cambridge. Eles fundaram uma empresa conhecida como Solexa em 1998. Então a Illumina comprou a Solexa em 2007, melhorando rapidamente a tecnologia original. Portanto, o método também é chamado Método de sequenciação Solexa / Illumina. A principal vantagem do sequenciamento Illumina é que ele oferece um alto rendimento de leituras sem erros.

Como funciona o sequenciamento Illumina

As quatro etapas envolvidas no sequenciamento Illumina são descritas abaixo.

Etapa 1. Preparação da biblioteca

Figura 1: Tagmentação e adição de motivos

Etapa 2. Geração de Cluster

Figura 2: Célula de fluxo

Figura 3: amplificação clonal

Etapa 3. Sequenciamento

Primeira leitura da sequência reversa

Figura 4: Sequenciamento por Síntese

Índice 1 lido

Índice 2 lido

Segunda leitura da sequência de avanço

Etapa 4. Análise de dados

O vídeo a seguir explica o processo completo de sequenciamento Illumina.

Conclusão

O sequenciamento Illumina é um método de sequenciamento de última geração. O sequenciamento Illumina está envolvido na preparação de uma biblioteca de sequenciamento com fragmentos longos de DNA de 200-600 pares de bases. As quatro etapas envolvidas no sequenciamento Illumina são preparação da biblioteca, geração de cluster, sequenciamento e análise de dados. Como o sequenciamento Illumina fornece leituras de sequência com alta precisão, é o método de sequenciamento amplamente usado no mundo.

Referência:

1. “Tecnologia de Sequenciamento por Síntese (SBS).” Tecnologia de sequenciamento | Sequenciamento por síntese, disponível aqui.

Cortesia de imagem:

1. “DNA Processing Preparation” Por DMLapato - Própria obra (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 2. “Oligonucleotide chains in Flow Cell” Por DMLapato - Own work, (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 3. “ Sequenciamento por síntese Terminadores reversíveis ”Por Abizar Lakdawalla () - Eu criei este trabalho inteiramente por mim (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 4.“ Geração de Cluster ”Por DMLapato - Trabalho próprio (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia

Como funciona o sequenciamento Illumina