o principal diferença entre proteômica e transcriptômica é que o a proteômica é o estudo de todo o conjunto de proteínas produzidas por um determinado organismo, enquanto a transcriptômica é o estudo de todo o conjunto de mRNA sintetizado por um determinado organismo.

Proteômica e transcriptômica são duas áreas nas quais a expressão gênica de um determinado organismo é estudada.

Aplicações, mRNA, proteínas, proteômica, técnicas, transcriptômica

O que é Proteômica

Proteômica é o estudo em larga escala de proteomas. O proteoma se refere a todo o conjunto de proteínas produzidas por um determinado organismo ou célula. Portanto, um determinado tipo de organismo ou célula possui um proteoma único. As principais áreas de investigação da proteômica são as seguintes.

Várias tecnologias de alto rendimento, como espectroscopia de massa e diferença em eletroforese em gel (DIGE), estão envolvidas nos estudos proteômicos.

O que é transcriptômica

A transcriptômica é o estudo do transcriptoma de um determinado organismo ou célula. O transcriptoma se refere a todo o conjunto de mRNA no organismo ou na célula. No entanto, às vezes também se refere a todo o conjunto de RNA. O transcriptoma varia com as condições ambientais que o organismo ou a célula tem de enfrentar. Portanto, ele reflete o conjunto de RNA expresso em um momento definido sob um determinado conjunto de condições. A transcriptômica inclui a investigação do perfil da expressão e da análise da variante de fatia. Os microarrays de DNA e o RNA Seq são as duas principais tecnologias utilizadas na transcriptômica.

Figura 2: Microarray e RNA Seq

Semelhanças entre proteômica e transcriptômica

Diferença entre proteômica e transcriptômica

Definição

A proteômica se refere ao estudo dos proteomas e suas funções, enquanto a transcriptômica se refere ao estudo dos transcriptomas e suas funções.

Tipo de estudo

A proteômica estuda todo o conjunto de proteínas expressas, enquanto a transcriptômica estuda todo o conjunto de mRNA expresso em um determinado organismo.

Fenômenos

A proteômica estuda a estrutura e função 3D das proteínas e as interações proteína-proteína, enquanto a transcriptômica estuda a estrutura da sequência, as interações com o ambiente e as aplicações do mRNA.

Técnicas

A proteômica envolve espectroscopia de massa e eletroforese em gel de diferença (DIGE), enquanto a transcriptômica envolve microarray de DNA e RNA Seq como técnicas.

Áreas Importantes

Algumas das áreas importantes da proteômica são desenvolvimentos de banco de dados de proteoma, como SWISS-2DPAGE e desenvolvimento de software para design de drogas auxiliado por computador, enquanto a transcriptômica envolve o estudo de diferenciação celular, carcinogênese, mecanismos moleculares e vias de sinalização, que controlam o desenvolvimento embrionário inicial, como biomarcadores para a avaliação de risco de drogas ou produtos químicos e inferir relações filogenéticas entre os indivíduos.

Conclusão

A proteômica é o estudo de todo o conjunto de proteínas de um determinado organismo, enquanto a transcriptômica é o estudo de todo o conjunto de mRNA do organismo. Portanto, a principal diferença entre proteômica e transcriptômica é o tipo de estudo.

Referência:

1. “O que é proteômica?” Proteomics: An Introduction to EMBL-EBI Resources, 8 de junho de 2016, disponível aqui2. Lowe, Rohan et al. “Transcriptomics Technologies.” PLoS Computational Biology 13.5 (2017): e1005457. PMC. Rede. 10 de julho de 2018, disponível aqui

Cortesia de imagem:

1. “Exemplos de estruturas de proteínas” de Axel Griewel - Trabalho próprio (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia2. “Microarray and sequencing flow cell” Por Thomas Shafee - Trabalho próprio (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia